Про блокировку:
Вариант 1:
Отключить блокирование всплывающих окон
(Сервис -> Свойства обозревателя -> Конфиденциальность -> Снять галку с чекбокса "Блокировать всплывающие окна")
Вариант 2:
Перейти на другой браузер, более грамотно реагирующий на эти самые поп-апы
(Поставить Оперу, сделать так: Сервис -> Быстрые настройки -> Блокировать незапрашиваемые окна")
Про чистку:
А зачем вообще удалять пустые папки? Кто-нибудь может сказать, что они реально представляют собой угрозу стабильности системы?
ИМХО, важнее чистить реестр, но делать это только будучи уверенным в своих действиях (т.е. если твой уровень ниже адвансед-юзера, то лучше вообще не лезть туда). Что посоветую? Раз в месяц-два делать проход по системе программой JV16 Power Tools и удалять только те ключи, которые она пометила как безопасные. Файлы подчищать удобно прогой WinTools (разумеется, она отньюдь не единственная в этом классе, просто рекомендую её для чистки временных файлов и нерабочих ярлыков [по-умолчанию удаляет в корзину, можно вовремя всё восстановить]). А вообще лучше всего чиститься ручками - Total Commander в руки и вперёд вычислять, какие папки слишком разрослись. А самое главное - почистившись, не забыть сделать дефрагментацию (имхо, лучший для этого - Diskeeper).
И никогда не забывай об осторожности: семь раз отмерь, один раз отрежь. И не стоит делать чистку, просто из соображений "надо бы"
